In Pax Pamir schlüpfen die Spieler in die Rolle afghanischer Führer des 19. Jahrhunderts, die nach dem Zusammenbruch des Durrani-Reiches versuchen, einen neuen Staat zu gründen. In der westlichen Geschichte wird diese Zeit oft als „Das große Spiel“ bezeichnet, da die Europäer versuchten, Zentralasien als Schauplatz für ihre eigenen Rivalitäten zu nutzen. In diesem Spiel werden diese Reiche ausschließlich aus der Perspektive der Afghanen betrachtet, die versuchten, die eingreifenden Ferengi (Ausländer) für ihre eigenen Zwecke zu manipulieren.

Was das Gameplay angeht, ist Pax Pamir ein recht unkomplizierter Tableau-Builder. Die Spieler verbringen die meiste Zeit ihres Zuges damit, Karten auf einem zentralen Markt zu kaufen und diese Karten dann vor sich in einer einzigen Reihe, die als Feld bezeichnet wird, auszuspielen. Durch das Ausspielen von Karten werden der Karte des Spiels Einheiten hinzugefügt und Zugriff auf zusätzliche Aktionen gewährt, mit denen andere Spieler gestört und der Spielverlauf beeinflusst werden können. Der letzte Punkt ist hervorzuheben. Obwohl jeder seine eigene Kartenreihe aufbaut, bietet das Spiel den Spielern viele Möglichkeiten, sich direkt und indirekt gegenseitig zu beeinflussen.

Um zu überleben, organisieren sich die Spieler in Koalitionen. Während des Spiels wird die Dominanz der verschiedenen Koalitionen von den Spielern bewertet, wenn eine spezielle Karte namens „Dominanzcheck“ gelöst wird. Wenn eine einzelne Koalition bei einer dieser Prüfungen einen souveränen Vorsprung hat, erhalten die Spieler, die dieser Koalition treu ergeben sind, Siegpunkte basierend auf ihrem Einfluss in ihrer Koalition. Bleibt Afghanistan jedoch bei einer dieser Überprüfungen fragmentiert, erhalten die Spieler stattdessen Siegpunkte basierend auf ihrer persönlichen Machtbasis.

Nach jeder Dominanzprüfung wird der Sieg überprüft und das Spiel wird teilweise zurückgesetzt, sodass die Spieler einen neuen Versuch unternehmen können, ihre Ambitionen zu verwirklichen. Das Spiel endet, wenn ein einzelner Spieler einen Vorsprung von vier oder mehr Siegpunkten erreichen kann oder nachdem die vierte und letzte Dominanzüberprüfung durchgeführt wurde.