In Meister Makatsu konkurrieren die Spieler mit ihren Ninjas um die Gunst des berühmten Meisters, indem sie ihre Beherrschung von perfektem Timing und strategischen Bewegungen unter Beweis stellen.

Jeder hat sein eigenes Kartenspiel mit 24 Karten, mit den Kartennummern 1-8 in drei Farben. Sie müssen diese Karten über drei Runden hinweg mit Bedacht ausspielen, denn in jeder Runde erhält derjenige, der die höchste Karte einer Farbe ausspielt, Punkte in Höhe der Rundenzahl. Ausgespielte Karten werden aus dem Spiel entfernt, während nicht ausgespielte Handkarten in Ihr Deck zurückkommen und in den folgenden Runden verwendet werden können.

Am Ende gewinnt, wer die wenigsten Punkte hat.